中科院、社科院、工程院、自然科學基金會緊緊圍繞為各領域科學研究創造良好氛圍和制度環境，牢牢抓住本單位反映突出問題和關鍵症結抓整改，努力引領學術科研新風。
中科院聚焦提高科研經費使用效率和科技成果轉化率抓整改。根據《黨政機關厲行節約反對浪費條例》制定實施細則，嚴格控制“三公”經費，確保年度經費預算壓縮5%。推進科技資源配置和科研經費管理改革，加大對重大科技任務的經費預算和支出監管力度。總結推廣院屬單位在試劑耗材、小型基建等領域經費管理有效做法和典型案例。深入分院和研究所，圍繞科研經費監管，開展廉潔從業風險防控工作調研督導。在院直屬事業單位和研究所推廣科研經濟業務真實性合法性審計，構建科研項目經費管理使用常態化監督機制。整合學科優勢、科研團隊優勢等創新資源，探索跨研究所、跨領域協同創新的體制機制，啟動首批卓越創新中心建設工作。完善重大產出導向的科研評價體系，更加注重研究所發展方向、研究質量等實際貢獻，不再以論文發表數量論英雄﹔研究制定《中科院與地方共建轉移轉化管理辦法》，修訂完善知識產權管理和運營制度，完善促進成果轉化和產業化的政策導向和激勵機制。
社科院逐項強化制度建設構筑長效機制。院黨組帶頭從嚴要求，制定黨組貫徹落實中央八項規定實施細則，進一步完善黨組會議、院務會議、院長辦公會議、黨組民主生活會和中心組學習制度，明確並細化黨組成員“堅定、團結、勤政、自律”4項要求。著力建設馬克思主義堅強陣地，出台《關於加強黨的意識形態工作建設馬克思主義堅強陣地的意見》，明確每年召開1次馬克思主義理論學科建設與理論研究工作會議，推動形成馬克思主義理論研究學科群，加強對各種社會思潮、輿情動態信息收集和分析研判。著力加強學風建設，成立由資深學者組成的學術道德委員會，加強對學術不端行為的查糾力度，明確對政治紀律、科研導向出現問題的一票否決。著力加強思想庫建設，出台《關於加強黨和國家重要思想庫建設的若干意見》，強調以重大理論和現實問題為主攻方向，推出一批有影響力的研究成果，提出高水平分析報告和對策建議﹔強力推進“走出去”戰略，提升中國哲學社會科學國際影響力和話語權。著力加強機關作風建設，出台改進機關工作作風若干規定，實行工作事項限期辦理和首問負責制，定期組織業務考試，推行量化考核，嚴格考勤紀律。
工程院直面問題出實招改起來。淨化院士遴選風氣，改革院士管理制度，成立改革院士遴選和管理機制領導小組和專家組，結合“中國工程院改革完善院士制度”和“中國工程院院士科學道德建設若干重要問題”2項咨詢研究，制定整改落實計劃和時間表，堅決治理院士增選過程中的“助選拉票”不正之風，優化學科結構、擴大中青年優秀人才比例，推動建設一支高水平、高質量、規模適度、風清氣正、年富力強的院士隊伍。推動戰略咨詢管理規范化制度化，圍繞加強國家工程科技思想庫建設，緊盯戰略咨詢薄弱環節，按照服務決策、適度超前原則，制定戰略咨詢制度建設計劃書和時間表，建立完善項目選題和立項制度，完善咨詢研究項目的全過程管理、經費管理和促進咨詢成果應用的制度。提升學術和出版活動質量，面向學術與出版委員會委員及其辦公室成員、學部辦公室、有關院士、相關單位開展問卷調查，找准學術活動和出版刊物質量不高、影響力不強的根源，掌握地方、院校對工程院學術出版活動的需求，及時調整學術和出版活動發展方向和預期目標。
自然科學基金會標本兼治提高基金運行效能。一是嚴肅曝光科研不端行為。回應基金依托單位、評審專家和項目申請人關切，舉辦“捍衛科學道德，反對科研不端”通報會，通報近3年受理科研不端行為投訴舉報和處理情況，公布6個典型案例，並在主流媒體曝光，得到普遍好評。二是構建支助科學研究良好制度環境。加強黨組自身制度建設，修訂或新制定黨組工作規則、黨組學習制度、領導班子密切聯系群眾若干規定。完善嚴控“三公”經費制度機制，大力壓縮公務接待費支出。出台加強因公臨時出國（境）管理規定，嚴格規范各種名目的出訪活動。積極實施集約、簡約、節約管理，圍繞優化評審程序、提高評審質量、降低評審成本、完善實施管理、提高技術服務等，開展政策調研。三是務實謀劃基金長遠發展。提出打造基金管理升級版的戰略構想，圍繞建設“科學家之友”，提出以信息化帶動評審過程智能化、以管理崗位輪換促進學科交叉、以品質提升促進基金管理精細化、以完善的人才支助格局穩定支持科學家發展的戰略實現途徑。
